La atención sanitaria a la transexualidad sufre importantes desigualdades territoriales en España. Instituciones internacionales como la World Professional Association Transgender Health recomiendan una asistencia multidisciplinaria. En el país nueve de las 17 comunidades autónomas han diseñado un protocolo de atención a la transexualidad y únicamente cuatro de ellas (Andalucía, Madrid, Cataluña y País Vasco) contemplan la cirugía reconstructiva genital.